膜蛋白具有多種功能,在細(xì)胞辨識(shí)、細(xì)胞訊號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、運(yùn)輸?shù)扔兄兄匾慕巧蚨彩墙^佳的抗生素靶向。抽提膜蛋白主要是進(jìn)行蛋白組剖析:常用的實(shí)驗(yàn)是非變性膠電泳、酶活剖析、SDS-PAGE、blot等。本文表述了總蛋白的抽提方式、和膜蛋白的提取方式。
一、從新鮮樣品中提取總蛋白(簡(jiǎn)易法)
1.自配裂解液(pH8.5-9.0):50mMTris-HCl,2mMEDTA,100mMNaCl,0.5%X-100,調(diào)pH值至8.5-9.0備用;用前加入100μg/ml溶菌酶,1μl/ml的蛋白酶抑制劑PMSF。該裂解液藥量為10-50ml裂解液/1g濕菌體。
2.將40ml菌液在12000g,4℃下離心15分鐘搜集菌體,沉淀用PBS漂浮漂洗2遍,沉淀加入1ml裂解液漂浮菌體。
3.超聲粉碎,采用300w,10s超聲/10s間隔,超聲20min,反復(fù)凍融超聲3次至菌液變清或則變色。
4.1000g離心除去大碎片,上清可直接變性后PAGE電泳檢查,或則用1%SDS堿液透析后凍存。
缺點(diǎn):結(jié)果表明,疏水性跨膜蛋白提取效率有限。
二、從裂解液中分離總蛋白
1.溶化的樣品碾磨破碎后,加乙酸分層,2-8℃下10000g離心15min,下層水相用于RNA提取,容積約為總體積的60%。
2.用乙酸沉淀中間層和有機(jī)相中的DNA。每使用1ml加入0.3ml無水乙酸混勻,溫度放置3min,2-8℃不超過2000g離心5min。
3.將上清移至新的EP管中,用異戊烷沉淀蛋白質(zhì)。每使用1ml加入1.5ml異戊烷,溫度放置10min,2-8℃下12000g離心10min,棄上清。
4.用富含0.3M硫酸胍的95%乙酸漂洗。每1ml加入2ml洗劑細(xì)胞膜糖蛋白,溫度放置20min,2-8℃下7500g離心5min,棄上清,重復(fù)漂洗2次。最后加入2ml無水乙酸,渦旋后溫度放置20min,2-8℃下7500g離心5min,棄上清。
5.冷藏干燥5-10min,1%SDS堿液溶化,反復(fù)吹打,50℃溫浴使其完全溶化,2-8℃下10000g離心10min消除不溶物。
6.取代方案:將3中的酚醇?jí)A液移至小分子量透析袋中,在2-8℃的1%SDS氨水中透析3次,1000g離心10min消除沉淀,上清可直接用于蛋白實(shí)驗(yàn)。
三、從新鮮樣品中提取疏水性膜蛋白(X-114去污劑法)
1.配制疏水性蛋白提取液(非裂解液):1%X-114,150mMNaCl,10mMTris-HCl,1mMEDTA,調(diào)pH值至8.0備用。
2.菌液于4℃條件下15000g離心15min搜集菌體;用1ml富含5mMMgCl2的PBS漂洗3次,最后于4℃條件下15000g離心15min搜集菌體。
3.菌體沉淀加入1ml冷提取液,于4℃條件下放置2h,17000g離心10min,除去沉淀取上清。
4.將上述上清中的X-114濃度降低到2%,再加入20mM的CaCl2抑制部份蛋白酶活性細(xì)胞膜糖蛋白,37℃條件下放置10min使其分層。溫度下1000g離心10min使固相和去污相充分分層。
5.將固相和去污相分開,分別用10倍容積的冷乙醇在冰上沉淀45min。
6.于4℃條件下17000g離心30min,用去離子水漂洗沉淀3次。
7.將沉淀溶化在1%SDS氨水中,測(cè)定蛋白含量,比較氣相和去污相中蛋白提取效率,通常是去污相中疏水性膜蛋白較多,易于進(jìn)一步蛋白實(shí)驗(yàn)。
8.SDS-PAGE進(jìn)一步剖析氣相和去污相的蛋白圖譜。
注意事項(xiàng):膜蛋白的濃度比較少,須要搜集比較多的細(xì)胞,最好是用試劑盒提取膜蛋白如:上海凱基的是試劑盒、膜蛋白提取試劑盒、碧云天膜蛋白提取試劑。