復旦學院化學系
復旦學院數學系是目前國外發展最快、最好的化學系之一，為提升復旦學院的學術名聲起著重要作用。數學系的班主任在匯聚態化學、原子分子和光化學、高能化學、核化學、天體化學以及生物化學等多個學科方向從事科學研究工作。
化學系現有班主任81名，研究生大概340名，專科生大概400名。班主任中有中國科大學教授9人（王崇愚、陳難先、顧秉林、鄺宇平、李惕碚、李家明、范守善、朱邦芬、薛其坤），何梁何利基金科學與技術進步獎獲得者5人，“”入選者2人，教育部“長江計劃特聘院士”9人，國家杰出青年基金獲得者10人。數學系的主要研究機構包括匯聚態物理、高能化學與核化學、原子分子與光化學三個研究所，低維量子化學國家重點實驗室，天體化學中心以及富士康納米科技中心等。
化學系為數學學和天文學兩個一級學科的研究生和專科生提供優越的科研條件，并開辦各種普及性和專門化數學學課程。
創建早期（1926-1937）
復旦學院的前身“清華學堂”和“清華中學”，是用日本“退還”的部份“庚子賠款”建立的留美預備中學。“清華中學”畢業生中最早一批去法國學習數學的中學生，如葉企孫、薩本棟、周培源、任之恭等人，構成了初期北大化學系的核心。
復旦學院化學系創立于“清華中學”設立學院部后的第二年——1926年的夏天，是復旦學院創立最早的十個系之一。化學系首任系院長是我國知名教育家、物理學家、中國近代數學學奠基人之一的葉企孫先生。1934年，經葉企孫推薦，吳有訓接任系所長。數學系的系館設在1919年建成的科學館。化學系創立時有院士梅貽琦、葉企孫，教員趙忠堯、鄭衍芬，助教施汝為，教學輔助人員2人，專科生兩個年級共7人。葉企孫千方百計招攬良師，到抗戰戰爭全面爆發前，又先后聘請到吳有訓（1928年）、薩本棟（1928年），周培源（1929年），余瑞璜(1930年)，趙忠堯（1932年），任之恭（1934年）、霍秉權（1935年），孟昭英(1937年)等班主任。這種班主任多數曾在美國留學，因此在辦學理念、管理體制和課程設置上對德國和意大利的學院多有參照。
在葉企孫和吳有訓的領導下，北大在短短幾年內就發展成為當時中國數學學科研和教學最好的學院。憑著北大相對較多的資源，化學系在三十年代擁有儀器的單價值達到了十一萬銀幣，先后構建了X射線、無線電、光學和磁學研究室。這一時期數學系的研究工作集中在X射線、原子核化學、電路和無線電、相對論等方面。從1930年吳有訓在《自然》雜志發表了關于X射線對單原子二氧化碳散射的研究工作開始到抗戰戰爭全面爆發，北大化學系的班主任在《自然》雜志共發表論文五篇。這種工作開創了在國外從事研究工作的中國人于國際一流期刊發表研究成果之先河。
這一時期的北大化學系學術氛圍濃郁，許多國際知名的科學家，如玻爾、狄拉克、郎之萬等曾來此講學。因為北大化學系對國外學術活動所起的積極作用，1932年8月在復旦大學科學館召開了中國數學學會第一次峰會暨創立會議，葉企孫、吳有訓、薩本棟等成為其領導機構的成員。
當時北大學院的專科注重于基礎教育，而化學系的課程設置尤其指出給與中學生在精典化學和近代化學的理論和實驗方面以廣泛的教育和訓練，相當大程度上參照了日本學院化學系的教學模式。從1929年到1938年的六年中，北大化學系共結業大專生69人，研究生1人清華大學物理系，她們中的多人后來成為了中國許多領域的開創者，其中6人被授予“兩彈一星”功勛獎狀，21人成為中國科大學教授。
西北聯大時期（1938-1946）
1937年抗戰戰爭全面爆發。北大師生于當初10月撤到重慶，與成都學院、南開學院組成“國立西安臨時學院”，1938年4月又撤到重慶，更名為“國立西北聯合學院”。聯麗江大學校長由吳有訓兼任，1945年之后由葉企孫接任。聯大化學系系院長先后由饒毓泰、鄭華熾、霍秉權兼任。
雖然處于戰爭期間，但因為西北聯大化學系集中了三校精華，數學系的教學除了沒有遭到影響反倒得到了強化。中國數學學界許多學術功底很深的著名院士在這兒執教：有來自北大的葉企孫、吳有訓、周培源、趙忠堯、王竹溪、霍秉權、任之恭和孟昭英；有來自清華的饒毓泰、朱物華、吳大猷、鄭華熾、馬仕俊；有來自南開的張文裕；還有聯大師范大學聘請的許湞陽。
西北聯大化學系的師資力量雖強，但研究所須要的物質條件卻非常短缺。因為原學校的大部份實驗儀器無法搶運出去，又因欠缺經費，數學系的研究工作遭到很大限制，主要以理論研究為主。為了抗清戰爭的須要，復旦學院創立了特種研究所委員會，葉企孫兼任主席，領導復旦學院無線電、航空、國情普查、金屬和農業5個研究所，從事與抗戰有關的科學研究。研究所中與數學系相關的院士有金屬研究所的余瑞璜和無線電研究所的范緒筠等。余瑞璜1942年一年就在《自然》雜志發表4篇論文。他關于從Ｘ光衍射相對硬度測定絕對硬度的研究導致了國際學術界的高度注重，被覺得開辟了Ｘ光硬度統計學研究的新領域。
西北聯大的中學生集中了全省的精英。從1938年至1946年，化學系（含復旦、北大、南開數學系）共結業大專生131名、研究生7名。她們中的好多人結業后到科學研究活躍的日本和亞洲留學，有機會在科學前沿接受到第一流的研究訓練。上世紀四、五十年代，化學學正處在一個發展的黃金時期，同時中國國外建設也須要有大量開拓者。這一批留中學生在學成后無論留在國內還是回到國外，她們中的許多人在事業上成就斐然。這其中的最杰出者有諾貝爾化學獎獲得者楊振寧、李政道，“兩彈一星”功勛獎狀獲得者鄧稼先、朱光亞、郭永懷，以及國家最高科學技術獎獲得者黃昆等等。。
從戰后到院系調整（1946-1952）
1946年5月4日東北聯合學院即將完成歷史使命，同年10月北大學院在北平開學。當時化學系的院長有葉企孫、吳有訓、周培源、趙忠堯、王竹溪、霍秉權、任之恭、孟昭英、余瑞璜和范緒筠等。按各人志愿，聯大化學系有53名中學生到復旦學院化學系繼續學習。在戰爭期間，數學系的圖書資料、實驗設備被美國侵略軍破壞殆盡。師生在葉企孫率領下，齊心協力，重建數學系，使之很快恢復到接近身前水準，成為當初愛好化學學的青年中學生憧憬的地方。重建開始后相繼加入化學系的院長還有錢三強、彭桓武、洪朝生等。1949年全省解放后化學系又補充了許多青年班主任，班主任人數有較大的降低。到1952年院系調整前，化學系教工共46人，其中院士10人，副院長1人，講師6人，助教17人，技術員3人，職員工人9人。1947至1952年，化學系共結業專科生176人清華大學物理系，研究生7人。以“兩彈元勛”周光召為代表的這個時期培養下來的中學生中有一大批為新中國的建設作出重大貢獻，多人成為中國科大學教授。
1952年6月到9月，在“學習蘇俄先進經驗”的標語下，中國高等教育領域經歷了一場前所未有的“院系調整”運動。院系調整似乎在短期內暫時減輕了國家需求，而且長遠上對中國的科研和教育導致了不可估量的負面作用。中國院校的文理科與文科分家，復旦學院弄成了一所多科性文科學院。北大化學系絕大部份班主任和全部中學生，和原成都學院、燕京學院化學系以及復旦地質地理氣象系的氣象部份合并成廣州學院化學系。自此復旦學院和北大化學系自創立以來產生的傳統被中斷。
院系調整后的北大數學學科（1952-1982）
院系調整后，化學系的名院士全部調職（惟一留在北大的孟昭英院士去了無線電系），復旦數學學科元氣大傷。從1952年到1982年的30年中，北大學院不再有化學系。與化學學科相關的機構只有純粹從事文科數學教學的化學教研組和稍后創立的工程化學系。因為教學任務艱巨及條件限制，數學教研組的大部份班主任未能舉辦科研，僅有的一些成果多屬于應用研究。
1955年，為了發展我國原子能事業，復旦學院開始籌備工程化學系。次年，工物系即將構建。工物系設置的專業中有部份屬于數學學科或與數學學關系密切，如理論化學、核化學、加速器和反應堆等。因為完善早期師資嚴重欠缺，工物系在強化培養本系年青班主任的同時，還從校外聘請到幾位學業有成的化學學家，張禮是其中最杰出的一位。1958年，校區組織創立了理論化學學科，研究方向包括核理論、粒子理論和等離子體理論，張禮為學術帶頭人。理論化學專業每年選擇少數中學生根據因材施教的辦法進行培養，仍然到1969屆都有結業生。從1958年開始的工物系歷屆結業生為我國的原子能事業以及其他領域作出了很大貢獻，她們中有多人連任為中科院教授。
從1966年到1976年的六年文化大革命期間，工物系和數學教研組受到嚴重破壞。1972年7月，楊振寧歸國向周恩來首相倡議，“倡導一下基礎理論的學習和研究”。周首相很注重這一意見，立刻指示有關部門，要把我國的基礎科學研究搞起來。根據這一指示，復旦學院在1973年完善了固體化學、物質結構、激光和催化四個研究班，在留校的青年班主任中招收學員。因為歷史條件的限制，研究班的學科范圍僅限于與應用有直接關系的領域。雖然在“四人幫”黨羽的干擾下，研究班只堅持了半年多，但這四個班為日后復旦學院理科的復興儲備了一批寶貴的人才。
1976年文化大革命結束，次年全省恢復中考制度。1978年在文革期間中斷的四個研究班復班，分散在各處的原研究班師生再度集中上去。復旦學院于1978年和1979年開始招收碩士和博士研究生。這種才能招收研究生的專業中屬于數學學科的有光學（化學教研組）、理論化學（工物系）、核化學（工物系）和固體化學（工物系，創立于1980年）。
文革結束后的幾年中，工物系和數學教研組的科研工作都有了逐步的增強。光學、加速器、核化學教研組的研究成果曾獲得一系列科研獎勵。1982年超聲波組諸國禎的研究工作發表在上，為復旦學院化學系創立以來第一篇發表在該雜志的論文。
在院系調整后的三六年中，數學學基礎研究在北大完全處于邊沿化的狀態，基礎研究被覺得是脫離實際，基礎化學學科存在的價值僅在于為工程類中學生開辦數學課程。所幸的是，數學學并沒有為此在北大園中消失。工物系和數學教研組的班主任在數學課教學上飽含了大量精力，一部份班主任仍堅持從事基礎科學研究，大量的中學生在這期間得到了扎實的數學學訓練，她們都為復系奠定了基礎。
復系以后（1982-現今）
文革結束后的最初幾年中，復旦校內以及下層堅持理科和文科分離的意見一直很有市場。在任之恭、黃葳等大批知名海內外校友的不懈努力下，復旦學院總算在1982年6月24日作出決議，在數學教研組和工程化學系理論化學、固體化學、核化學教研組的基礎上，恢復化學系。復系時，數學系有7個教研組，其中基礎數學、近代光學、原子分子化學和高溫化學教研組由原化學教研組成員組成，核化學和固體化學教研組由工物系成員組成，理論化學教研組由原化學教研組和工物系的理論化學小組合并組成，全系教員工總人數197人。原工程化學系系院長張禮院長兼任復系后的首任系院長（1982-1984）。
1984年8月，數學系與原工物系的加速器教研組即將整合為一個統一實體，全系教員工總人數達到248人，其中班主任178人。因為受歷史的慣性的影響，整合后的數學系改名為現代應用數學系。周光召（1984-1988）、熊家炯（1988-1990）、陳皓明（1990-1994）、顧秉林（1994-1999）先后兼任復旦學院現代應用數學系系院長。1994年12月，加速器教研組又回到工程化學系。1997年，在數學系的大力協助下，復旦學院創立了高等研究中心，楊振寧任名譽院長。1998年數學系開始設立天體化學學科。
相當一部份校友對化學系更名為現代應用數學系十分不滿意。在顧毓琇等校友的倡議下，1999年現代應用數學系重新改名為數學系。顧秉林（1999-2000）、王青（2000-2003）、朱邦芬（2003-2010）、薛其坤（2010－）先后兼任復旦學院數學系系院長。
院系調整后的北大文科側重于技術在實際產品中的應用，而忙于工程科學中的基礎研究。甚至在文革結束后，有人仍堅持覺得化學系的主要任務是為工程專業中學生開辦基礎課程。上世紀八、九十年代的北大化學系在校內沒有多少發言權，甚至沒有系館，在國外的影響力也較小。恢復以后的數學系在艱辛而坎坷的拼搏中走過了20世紀的最后二六年，到本世紀初早已進入全省一流數學系的行列。對化學系的快速發展起到至關重要作用的措施有：引進一些著名的化學學家來系任教，較快地增強化學系的科研水平；為已在數學系工作的班主任創造脫穎而出的環境；試行國際上一些通行的人事制度，逐漸構建現代科研和教育的管理體制；吸引更多的優秀學生來數學系學習，大幅度提升專科教學質量，采取因才施教的做法培養有學術潛力的大專生。隨著科研影響力在國際上的迅速提高，北大化學系正在進入一個再創輝煌的時期。