經過幾代人的不懈努力，能源與動力工程系已成為我國熱流科學、清潔能源、先進動力和能源戰略領域享有美譽的中級人才培養基地和基礎科學、關鍵技術的重要研制基地，也是國際著名的學術交流中心。
能源與動力工程系的前身是復旦學院1932年籌建的機械工程學系原動力工程組，1952年創立動力機械系，1978年更名為熱能工程系，2017年改名為能源與動力工程系。
能源與動力工程系下設“熱能工程”、“工程熱化學”、“燃氣輪機”、“熱能動力仿真與控制”和“流體機械及工程”5個研究所。“清華學院燃燒能源中心”掛靠我系。
能源與動力工程系設有“能源與動力工程”本科專業和“動力工程及工程熱化學”一級學科，下設“工程熱化學”、“熱能工程”、“動力機械及工程”、“流體機械及工程”四個二級學科，其中“工程熱化學”、“熱能工程”、“動力機械及工程”是國家重點學科，在歷次全省學科評估中名列前茅。可授予工學學士、工學碩士和工學博士學位，以及能源與環保/能源動力領域的工程博士學位和動力工程、能源動力、工程管理領域的專業碩士學位。
能源與動力工程系擁有一支杰出人才凝聚、具有重要國外外學術影響的高水平師資隊伍。現有正中級職稱40人動力工程及工程熱物理考研學校排名，副中級職稱41人，高級職稱17人。其中，科大學教授1人，工程院教授2人，外籍教授2人，獲國家級人才稱號23余人次，獲上海市教學名師3人。3人獲何梁何利獎，2人獲光華工程獎。
能源與動力工程系在全省首批構建“動力工程及工程熱化學”博士后流動站，并連續獲評“全國優秀博士后科研流動站”。
能源與動力工程系一直把人才培養作為根本任務。經過多年的實踐和建立動力工程及工程熱物理考研學校排名，完善了內容豐富、結構完整、形式新穎的專科生和硏究生培養體系，其中包括以“工程熱力學”、“傳熱學”、“燃燒理論”等國家精品課程為代表的優質課程，以“動力工程及工程熱化學”國家級實驗教學示范中心為平臺的教學實踐環節，以國外骨干企業為依托的生產實踐基地，以及以世界名校為伙伴的國際化培養渠道，培養了大批具備社會責任感、寬厚基礎、創新思維、全球視野和完善人格的能源動力領域拔尖創新人才。
能源與動力工程系緊隨世界科技發展前沿，在進列寬水平基礎研究和關鍵技術研制的同時，面向國家重大需求和國民經濟主戰場，努力將科學技術成果轉化為生產力。先后完成多項國家級和省部委重點科研項目，廣泛舉辦與國外外企業的校企合作，多次獲得國家、省部委和行業商會獎勵。其中，獲國家級科技獎勵20余項，為能源、動力、國防、航空航天及環境保護等領域的學術發展與技術進步作出了重要貢獻。
能源與動力工程系與國際一流學院、研究機構和知名能源企業構建了廣泛的聯系和高水平、實質性合作，創立了一批聯合硏究機構，對寬闊國際視野、開展前沿性基礎研究和新技術開發起到了重要促進作用。
