?新型冠狀病毒引起的新型冠狀病毒腦炎是當(dāng)前全球關(guān)注的公共健康問題。新型冠狀病毒(SARS-CoV-2)除了傳播迅速,并且具有致命性。截止2020年6月7日,新型冠狀病毒早已感染超過700千人,并搶走了超過40千人的生命。
2020年4月3日,《紐約晨報》著名專欄畫家Carl和《紐約晨報》科學(xué)圖形編輯Corum發(fā)表了題為"BadNewsin:the"的文章。該文章將SARS-CoV-2編碼的29種蛋白以模式圖和簡明易懂的文字呈現(xiàn)下來。
病毒必須感染步入活細胞能夠進行復(fù)制和傳播。當(dāng)SARS-CoV-2病毒找到合適的細胞時,它會注入一條包含整個基因組的RNA鏈。SARS-CoV-2病毒的基因組不到30000個核苷酸,研究學(xué)者早已鑒別出基因組才能轉(zhuǎn)錄多達29種蛋白質(zhì)。為學(xué)者們對其他冠狀病毒的研究提供了了解SARS-CoV-2蛋白的途徑。
SARS-CoV-2的基因組分為非結(jié)構(gòu)基因和結(jié)構(gòu)基因兩個部份。其中約占SARS-CoV-2全基因組總寬度三分之二的非結(jié)構(gòu)基因富含兩段編碼蛋白質(zhì)的序列,稱為ORF1a和ORF1b;而緊跟其后的結(jié)構(gòu)基因區(qū)域則編碼S(Spike)、E、M、N結(jié)構(gòu)蛋白。
(圖1:SARS-CoV-2的29種蛋白質(zhì))
結(jié)構(gòu)蛋白
冠狀病毒結(jié)構(gòu)基因組依次編碼刺突蛋白(Spike)、包膜蛋白()、膜蛋白()和核衣殼蛋白()。
(圖2:SARS-CoV-2)
刺突蛋白(S蛋白)承當(dāng)病毒與寄主細胞膜受體結(jié)合及膜融合功能細胞膜受體,是寄主中和抗原的重要作用位點以及卡介苗設(shè)計的關(guān)鍵靶向。2019-nCoV的與人互作來感染人的呼吸道上皮細胞。
包膜蛋白(E蛋白)和膜蛋白(M蛋白)是冠狀病毒高效組裝的關(guān)鍵。
E蛋白
M蛋白參與病毒包膜的產(chǎn)生和發(fā)芽過程,即參與病毒的組裝和病毒釋放,抑制IFN功擊。二者可用于測量抗原。
核衣殼蛋白(N蛋白)是冠狀病毒中濃度最豐富的蛋白。在病毒體組裝過程中,N蛋白與病毒RNA結(jié)合并造成螺旋核衣殼的產(chǎn)生??梢越柚鶱蛋白構(gòu)建快速檢查2019-nCoV血漿抗原方式,也可以進一步制備單抗或舉辦解析該蛋白結(jié)構(gòu)等研究。
非結(jié)構(gòu)蛋白
SARS-CoV-2是一種正鏈RNA病毒,它的復(fù)制是由病毒非結(jié)構(gòu)蛋白(nsp)的多亞基復(fù)制/轉(zhuǎn)錄復(fù)合物介導(dǎo)的。
SARS-CoV-2非結(jié)構(gòu)基因中有兩個大的重疊開放閱讀框(ORF),分別是ORF1a和ORF1b。每位都有一個編碼16個預(yù)測的Nsps(如圖1),主要是負責(zé)編碼與病毒復(fù)制、轉(zhuǎn)錄相關(guān)的酶。
取消標記和切割蛋白·NSP3
NSP3是一種具有兩個重要功能的蛋白質(zhì),一是切割其他病毒蛋白,便于行使各自的功能。它就會改變許多被感染細胞的蛋白質(zhì)。一般健康的細胞會標記舊蛋白質(zhì)以進行降解。并且SARS-CoV-2病毒可以消除這種標簽細胞膜受體,改變蛋白質(zhì)的平衡,增加細胞抵抗病毒的能力。
蛋白質(zhì)剪子·NSP5
這些蛋白質(zhì)可以使大多數(shù)其他NSP蛋白質(zhì)從蛋白鏈上解放下來。
細胞中心·NSP9
這些蛋白質(zhì)會通過微小通道溶入被感染細胞的核中,它可能還能影響分子進出核的運動——但是出于哪些目的,還未知。
華美生物新冠非結(jié)構(gòu)蛋白產(chǎn)品
非結(jié)構(gòu)蛋白nsp3
acute2Non-3(nsp3),(CSB-)