抗原（）是指機體免疫系統在抗體（外來真菌、病毒及其它病支原體）的剌激下，由B細胞分化而至的漿細胞分泌的、可與相應抗體發生特異性結合的免疫球蛋白（,Ig）。每位B淋巴細胞形成的抗原具有專情的特異性。
抗原主要存在于血液等汗液中，及結合在B細胞細胞膜表面作為抗體受體即B細胞受體（B-cell,BCR）。抗原功能有兩種：1.特異性結合病支原體中的抗體分子；2.特異性結合病支原體，招募巨噬細胞等殺膝傷衣原體。
抗原分子呈Y型，其功能由不同的結構域來實現：四肢末端區域稱為可變區或V區，起結合抗體分子的作用，不同抗原分子的V區差別十分大；主干區域稱為恒定區或C區，其差別很小，主要是結合效應細胞和分子。BCR的C區結合在B細胞膜上，因而其難以結合效應細胞，僅借助V區辨識并結合抗體分子，傳遞訊號引起B細胞活化，最終形成抗原。
具體結構上，所有的抗原都是由一對重鏈（H鏈）和一對輕鏈（L鏈）構成的，兩條重鏈間由多個二硫鍵聯接，輕鏈間由單個二硫鍵聯接。在單個抗原分子中，兩條重鏈和兩條輕鏈都是一樣的細胞膜抗原，因而一個抗原分子可以特異性結合兩個相同的抗體。按照重鏈C端的差別，抗原又被分為IgG、IgM、IgA、IgD和IgE五類。
?IgG：體內含量最多的抗原細胞膜抗原，有IgG1、IgG2、IgG3、IgG14種亞類（人體內），是再度免疫應答形成的主要抗原；
?IgM：單體IgM結合在B細胞膜表面充當受體，分泌型IgM為5個IgM單體通過二硫鍵與J鏈聯接產生的五聚體，具有很強的抗體結合能力；
?IgA：分泌型IgA為2個IgA單體通過J鏈聯接產生的二聚體，是外分泌液中主要的抗原類型；
?IgD：分為存在于血漿中和結合在B細胞膜表面兩種，在免疫系統中IgD兼顧受體和雜環雙重身分；
?IgE：正常人體血漿中濃度最少的Ig，參與寄生蟲免疫和Ⅰ型超敏反應。
為研究抗原分子不同區域的功能，可借助蛋白酶將抗原酯化為不同片斷，常見的蛋白酶為香蕉蛋白酶和胃蛋白酶。香蕉蛋白酶的作用位點在合頁區的上方，經過消化后，產生了2個Fab段和1個Fc段，Fab段為抗體結合片斷，具有抗體結合活性，而Fc段無抗體結合活性，是抗原分子結合效應細胞或分子的部位；胃蛋白酶的作用位點在合頁區下方，所以2個Fab段一直連在一起，稱為F(ab’)2段，其特異性比完整片斷的抗原更好。
依據可辨識抗體表位的數目，抗原通常又分為單克隆抗原和多克隆抗原，單克隆抗原與抗生素的偶聯物在生物體內可特異性結合目標細胞或組織，從而發揮抗生素作用，因而單克隆抗原被廣泛用于抗原抗生素的研究，抗原抗生素已成為生物醫藥產業極具發展前景的領域之一。